Desbloquear los trajes de Metroid Fusion para Metroid Prime: Necesitarás una copia de Metroid Fusion para GBA y una copia de Metroid Prime para Gamecube. Luego conecta las dos versiones y tendrás esa opción en el menú.

Ver tu reflejo: Hay varios colgantes reflectantes colocados en el mundo de Tallon IV. Si te quedas enfrente podrás ver un reflejo de Samus.

Desbloquear galería de imágenes: Escanea el 50% del recurso y datos de las criaturas para poder ver la galería de imágenes.

Cambiar de Samus a diferentes personajes: Cuando comiences un nuevo juego, mientras observas la introducción debes mantener pulsados Z y R mientras introduces los siguientes códigos:

Kreana: L, arriba C, abajo C, derecha C, arriba C, abajo C, L, D arriba, D abajo, D derecha, D arriba, D abajo, derecha C, izquierda D, izquierda C, derecha D, arriba, izquierda, derecha, abajo.

Live Chonzo: Y, X, X, Y, A, B, B, A, L, L, abajo C, abajo, abajo, D abajo.

Starship Pilot: arriba, abajo, izquierda, derecha, derecha, izquierda, abajo, arriba, arriba, abajo

Kraid: L, L, B, X, Y, B, X, Y, A, A, D abajo, D arriba, D abajo, D arriba, D izquierda, izquierda C, L, L, B, X, Y, B, X, Y, A, A, A, A, Y, X, B, Y, X, B, L, L, izquierda C, D izquierda, D arriba, D abajo, D arriba, D abajo, A, A, Y, X, B, Y, X, B, L, L, A, B, X, Y.

Nota: Si has introducido los códigos correctamente verás la introducción y como el personaje que vas a controlar mata a Samus y toma su lugar.

Jugar la versión original NES Metroid en la GameCube a través de cable: Necesitarás una copia de Metroid Fusion para GBA y una copia de Metroid Prime para Gamecube. Luego conecta las dos versiones y podrás jugar a NES Metroid y salvar las partidas en la tarjeta de memoria de tu Gamecube.